日本9日開始實施新的外國人居留證制度，在日外國人必須申請新的“在留卡”。據日本新聞網、《產經新聞》等9日報道，在日臺灣人當天拿到的在留卡的“國籍、地域”一欄，不是像此前一樣記為“中國”，而是變成了“臺灣”。對此，日本法務省出入境管理局參事官室官員9日接受《環球時報》記者采訪時稱，這并不意味著日本要把臺灣當做國家對待，而是當做地域對待。該參事官解釋稱，日本過去的出入境管理制度規定，外國人登陸證明的“國籍等”一欄中必須填寫國籍，而新的外國人在留卡制度將臺灣當作“地域”對待，因此可以填入。
富士電視臺9日報道稱，為了減少外國人非法滯留，新外國人在留管理制度9日開始實施，此前使用的“外國人登陸證”將廢止，在日外國人必須申請新的在留卡。外國人登陸證明中的“國籍等”一欄，在留卡中被改為“國籍、地域”。報道稱，自1972年中日邦交正常化后，日本政府不承認臺灣的國家地位，贊同臺灣是中國的一部分。因此，在日臺灣人的“外國人登陸證”中的“國籍等”一欄中都填寫的是中國。但是新在留卡中臺灣人可以在“國籍、地域”欄中填寫臺灣。日本新聞網9日引述一名在日臺灣人的話稱，終于看到自己的在留卡國籍一欄被記入臺灣，“恢復了我真正的身份，很高興”。還有報道稱，由于準備不足，當天發放在留卡的不少地方出現混亂。
日本法務省出入境管理局參事官室官員對《環球時報》記者稱，日本之前的在留管理制度規定必須要讓外國人填寫國籍，臺灣不是國家所以不能填寫。但是伴隨著新制度的生效，在留管理制度被廢止，在留資格證明書也取消了。新的管理制度規定外國人必須辦理在留卡，在留卡上可以填寫國籍或者地域。《琉球新報》報道稱，新的在留卡制度實施后，合法滯留的在日臺灣人只要出示臺灣護照就可以將“國籍、地域”欄填為臺灣。這主要發放給合法在日3個月以上的臺灣華僑、留學生、技術人員等。
在日外國人在留卡制度從2009年3月開始提交國會審議。《產經新聞》當時曾報道稱，日本政府不承認臺灣是一個國家，但將臺灣護照定為“擁有行政法令規定地區權限的機關發行的文書”給予承認。除臺灣外，巴勒斯坦自治區也被賦予這樣的地位。自2007年開始，巴勒斯坦在外國人登陸證上被記入“國籍”，但臺灣的地位一直沒有改變，在日臺灣人還是必須填寫中國。截至2007年，在日中國籍登記人數約為60萬人，其中約4.2萬人為臺灣人。2001年7月，陳水扁執政時曾要求日本政府承認臺灣的國家地位，此后的2003年，李登輝也提出過同樣的要求，都被日本政府拒絕。《產經新聞》稱，日本新在留卡上臺灣人可以填寫國籍為臺灣，可以預想會引起中國政府的反對，這將考驗日本執政黨和在野黨的應對能力。（環球時報）