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Nature:科學(xué)家首次測序癌癥患者基因組

2010-05-28 11:19:08

來源:生物秀網(wǎng)

  美國科學(xué)家2008年首次成功測序了一個癌癥患者的基因組,這一開創(chuàng)性工作為利用新方法揭開癌癥的遺傳學(xué)基礎(chǔ)創(chuàng)造了條件。相關(guān)論文發(fā)表在11月6日的《自然》(Nature)雜志上。

  測序的基因組來自于一位女性,50多歲死于急性骨髓性白血病(AML)。美國華盛頓大學(xué)的研究人員利用來自皮膚樣本的遺傳材料,測序了她2套染色體的DNA,同時根據(jù)骨髓樣本檢測了其腫瘤細(xì)胞中的遺傳突變。所有樣本均采自患者接受癌癥治療前,以防DNA受到進一步損傷。

  隨后,研究人員將患者的腫瘤基因組與其正常基因組進行了比較,以期發(fā)現(xiàn)遺傳差異。在患者腫瘤基因組中接近270萬個單核苷變異中,將近98%同樣也在患者皮膚樣本的DNA中檢測到,這就大大縮小了進一步篩選的范圍。


急性骨髓性白血病細(xì)胞

  研究人員最終在患者的腫瘤DNA中僅發(fā)現(xiàn)了10個可能與AML有關(guān)的遺傳突變,其中8個很罕見,它們所處基因之前從未被認(rèn)為與AML有關(guān)。研究人員還顯示,腫瘤樣本中的每個細(xì)胞擁有9個突變,而且較少發(fā)生的那個突變可能是最后形成的。研究人員懷疑,所有這些突變對于患者的癌癥都很重要。

  美國國立人類基因組研究所前任主管Francis Collins說:“首次確定人類癌癥基因組的完全DNA序列,并與同一個體的正常組織相比較,這在癌癥研究中是一個真正的里程碑。”

  美國俄勒岡健康與科學(xué)大學(xué)癌癥研究所的Brian Druker說:“雖然這一研究尚不能告訴我們怎樣治療癌癥患者,但它是這條路上關(guān)鍵的第一步。它為大規(guī)模癌癥基因組測序和揭示癌癥秘密打下了基礎(chǔ)。”

  目前,研究小組正在測序其他AML患者的基因組,同時他們還計劃將這種全基因組方法擴展到乳腺癌和肺癌。

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